Así lo informó la presidenta de la Comunidad de Madrid, Esperanza Aguirre, en el Comité, al tiempo que destacó que su abandono se debe "a razones de trabajo".

En enero de 2010, Pizarro dejó su acta de diputado en el Congreso por razones "estrictamente personales", para volver al mundo de la empresa, de donde salió después de que le fichara el presidente del PP, Mariano Rajoy, para ir como "número 2" en las listas al Parlamento.

Tras la derrota del PP, Rajoy relegó al ex presidente de Endesa a un cargo menor, el de portavoz del PP en la Comisión Constitucional del Congreso, pese a que en su día fue presentado como el fichaje estrella del partido en materia económica tras la batalla librada en la eléctrica.

En marzo, Manuel Pizarro tomó posesión de su cargo como nuevo presidente del Consejo Social de la Universidad Autónoma de Madrid (UAM) en sustitución de José María Fluxá.