La salida ha provocado una ola de protestas entre asociaciones y grupos de periodistas, artistas, escritores y partidos políticos. Incluso, el tema ha sido llevado a la tribuna del Congreso de la Unión. Los columnistas culpan del despido de Aristegui a "uno de los dos cuñados incómodos" del presidente Felipe Calderón: Juan Ignacio Zavala, nombrado representante de PRISA en México.

El prestigioso analista Miguel Ángel Granados Chapa afirmó: "Tal vez se trata de una decisión estratégica, encaminada a fortalecer la posición del consorcio de la familia Polanco ante el Gobierno mexicano, en la misma dirección que lo llevó a contratar los servicios de José Ignacio Zavala, cuñado del presidente Calderón". Tras la polémica, en varias ocasiones Zavala ha declarado que no maneja las operaciones del Grupo Prisa en México y que su función en PRISA se circunscribe al periódico El País, concretamente como gerente de la Edición Global.

Textos con información de EFE, El Universal, La Crónica, La Jornada, Reforma, Televisa, TV Azteca y Público.