Otro de los temas que estudiará la Comisión Teológica será "un primer boceto del documento sobre la identidad de la naturaleza, así como habrá un intercambio de opiniones sobre los fundamentos de la ley moral natural en la línea de las encíclicas de Juan Pablo II "Veritatis splendor" y "Fides et ratio". Este asunto fue considerado del "máximo interés" por el Papa Juan Pablo II, por lo que en octubre de 2004 encomendó la creación de una Comisión Internacional, que hasta abril pasado estaba dirigida por el que era prefecto de la Congregación para Doctrina de la Fe, el actual pontífice, Benedicto XVI.
Desde hace un tiempo está en discusión la doctrina de origen medieval que coloca a los niños muertos sin haber cometido pecados, pero también sin haber sido bautizados -es decir, con la culpa del pecado original- en el limbo, un lugar sin tormentos pero alejado de Dios.